Memarlıq və Mühəndislik fakültəsi

İqtisadiyyat və İdarəetmə fakültəsi

Tibb fakültəsi

Pedaqoji fakültə

Təbiətşünaslıq və Kənd Təsərrüfatı fakültəsi

Xarici Dillər fakültəsi

Beynəlxalq Münasibətlər və Hüquq fakültəsi

Fizika-Riyaziyyat fakültəsi

Tarix-filologiya fakültəsi

Magistratura və Doktorantura Mərkəzi

İncəsənət fakültəsi

Əcnəbi təhsilalanlar və hazırlıq mərkəzi

Naxçıvan Dövlət Universitetinin nəzdində Naxçıvan Dövlət Texniki Kolleci

Naxçıvan Dövlət Universitetinin nəzdində Naxçıvan Tibb Kolleci

İqtisadiyyat və İdarəetmə fakültəsi (2-ci korpus)

NSU International school

Naxçıvan Dövlət Universitetinin nəzdində Naxçıvan Musiqi Kolleci